Le système de données COVID de l’équipe UTHSC mis en évidence dans le journal Disaster Medicine and Public Health Preparedness Journal

Le site de test COVID-19 au volant à Tiger Lane, créé grâce à une collaboration entre les professeurs de l’UTHSC et les responsables du gouvernement local, a fourni les données pour le système informatique de santé pandémique de Memphis (MEMPHI-SYS).

Lorsque COVID-19 a frappé le Mid-South en 2020, des chercheurs du Centre des sciences de la santé de l’Université du Tennessee ont rapidement compris à quel point Memphis avait du mal à suivre le rythme de la progression rapide de la pandémie. Alors, ils se sont mis au travail.

Dans un rapport récemment publié dans Médecine de catastrophe et préparation de la santé publiqueauteurs principaux David Schwartz, MD, FACR, professeur et président du Département de radio-oncologie au UTHSC College of Medicine, et Arash Shaban-Nejad, PhD, MPH, professeur agrégé et directeur de Population and Precision Health au Centre d’informatique biomédicale UTHSC-ORNLexpliquent comment ils ont aidé à diriger une équipe multidisciplinaire à l’UTHSC et à l’Université de Memphis pour créer un registre de données COVID-19 unique et axé sur la communauté appelé Memphis Pandemic Health Informatics System (MEMPHI-SYS).

Le registre est une émanation directe du site de test COVID-19 au volant à Tiger Lane au Mid-South Fairgrounds, une initiative dirigée par le Dr Schwartz en collaboration avec le département de la santé du comté de Shelby et la ville de Memphis pour mettre gratuitement les tests COVID à la disposition du public.

“Dr. Shaban-Nejad et moi avions travaillé ensemble dans le passé pour examiner le rôle de la science des données dans le traitement du cancer », a déclaré le Dr Schwartz. «Puisque nous collections des données cliniques, telles que les symptômes et le statut d’emploi des patients, sur le site de test de Tiger Lane, nous avons décidé de tirer parti de l’expertise clinique et de la science des données ici à l’UTHSC à Memphis pour commencer à répondre aux questions sur l’épidémiologie et les schémas de propagation. et la présentation de COVID dans les premiers jours de la pandémie.

Le Dr David Schwartz, à l’extrême gauche, et le Dr Jon McCullers du Collège de médecine, à l’extrême droite, posent avec des étudiants qui se sont portés volontaires pour faire partie du site de test Tiger Lane COVID-19.

Comme l’explique le rapport, intitulé The Memphis Pandemic Health Informatics System (MEMPHI-SYS) – Creating a Metropolitan COVID-19 Data Registry Linked Directly to Community Testing to Enhance Population Health Surveillance, les sites de test obligeaient les patients à prendre rendez-vous par téléphone. ou en utilisant un chatbot en ligne. Chaque patient a fourni ses informations démographiques, ses emplacements géographiques, ses antécédents médicaux, son historique d’exposition au COVID et ses facteurs de risque de complications du COVID. MEMPHI-SYS a fourni une plate-forme pour que les informations sur les patients soient collectées, analysées et compilées sur un tableau de bord conforme à la HIPAA où les prestataires de soins de santé, les partenaires communautaires, les fonctionnaires et les autres parties prenantes peuvent y accéder.

Selon les auteurs, un système comme MEMPHI-SYS était désespérément nécessaire à Memphis. Le Dr Schwartz a déclaré que lorsque COVID a frappé, la région manquait de ressources pour répondre aux grands événements de santé publique.

“Nous avons dû suivre un cours intensif sur la réponse aux maladies infectieuses au niveau métropolitain au milieu de la première urgence de santé publique à grande échelle de notre génération”, a déclaré le Dr Schwartz. «Il n’y a aucun moyen de pouvoir répondre avec des tests et des interventions localisés et dotés de ressources appropriées sans données. Nous n’avions pas cela en 2020, nous faisions donc à peu près nos meilleures suppositions pour savoir où placer ces ressources et comment dimensionner et étendre correctement ces ressources.

Alors qu’il a été créé en réponse au COVID, MEMPHI-SYS a été conçu de manière prospective. Grâce au registre, le Dr Shaban-Nejad a déclaré que les dirigeants seront en mesure de prendre des décisions mieux informées à l’avenir. “La plate-forme est indépendante des données, elle est donc facilement disponible pour être remplacée par toute autre catastrophe de santé publique”, a-t-il déclaré. “Nous pouvons utiliser ce système pour guider les dirigeants publics et éclairer l’élaboration des politiques et la prise de décision concernant l’allocation des ressources.”

« Je suis très fier du travail incroyable du Dr Schwartz et du Dr Shaban-Nejad. Non seulement ils étaient les leaders de notre stratégie initiale de lutte contre le COVID-19, mais leur travail a également abouti à un outil robuste pour lutter contre les menaces infectieuses à l’avenir.

Scott Strome, MD, doyen exécutif de la Collège de médecine

Selon le rapport, le registre servira également d’entrepôt de données pour aider à améliorer la surveillance de la santé de la population et à réduire les disparités en matière de santé et les risques sociaux dans les quartiers défavorisés. Le Bureau de l’engagement en santé communautaire de l’UTHSC College of Medicine prévoit de continuer à utiliser les données géographiques et démographiques de MEMPHI-SYS pour donner la priorité à la sensibilisation et à la distribution directe des ressources médicales, comportementales et sociales vers les quartiers qui en ont le plus besoin.

Les données peuvent également être utilisées pour anticiper, détecter et surveiller les problèmes de santé pouvant survenir dans certaines zones locales. « Si vous collectez des données historiques pour un patient, vous pouvez potentiellement prédire l’état de santé futur d’un patient. Maintenant, nous pouvons faire à peu près la même chose pour l’ensemble de la population de Memphis », a déclaré le Dr Shaban-Nejad.

MEMPHI-SYS ne contribue pas uniquement au domaine de la santé publique. Selon le Dr Shaban-Nejad, cela contribue également à l’avancement des technologies de l’intelligence artificielle (IA) et de la science des données. Le Dr Schwartz a vanté le travail de son homologue pour repousser les limites des technologies d’IA de pointe.

“Un gros problème avec l’IA est que les utilisateurs humains ne peuvent pas facilement voir comment un algorithme particulier fonctionne à l’intérieur de sa boîte noire”, a déclaré le Dr Schwartz. « L’aspect novateur du travail du Dr Shaban-Nejad est que nous sommes capables de regarder sous le capot. Sa plate-forme peut afficher un “tableau de bord” compréhensible pour l’esprit humain, montrant comment notre IA est parvenue à sa réponse en premier lieu. Notre objectif est de digérer une énorme quantité de données sociales, économiques et épidémiologiques d’une manière transparente et explicable que les prestataires, les patients et les responsables politiques peuvent rapidement comprendre et agir, même au cœur d’une urgence de santé publique. . C’est le niveau de préparation dont Memphis a besoin et auquel il doit s’attendre. Nous dirigerons le pays dans ce domaine.

Selon l’article, MEMPHI-SYS a été rendu possible grâce à une collaboration de cliniciens, de scientifiques des données, de biostatisticiens, d’experts en cartographie géospatiale, d’experts en sensibilisation communautaire et de spécialistes de la santé comportementale. Cinq autres membres principaux de l’équipe font partie du corps professoral de l’UTHSC : Robert Davis, MD, MPH, directeur fondateur du Centre d’informatique biomédicale de l’UTHSC-ORNL, a fourni une expertise en informatique biomédicale ; Fridtjof Thomas, PhD, professeur au Collège de médecine Département de médecine préventivea été le responsable de la science des données de l’équipe ; Karen C. Johnson, MD, MPH, présidente du Département de médecine préventive, a fourni du mentorat et une expérience en sciences de la santé des populations ; et Altha Stewart, MD, doyenne associée principale pour l’engagement en santé communautaire, et Laura Harris, PhD, professeure agrégée de psychiatrie au Collège de médecine, ont examiné les moyens de mettre en œuvre les données après leur placement dans le registre. Esra Ozdenerol, PhD, professeur de systèmes d’information géographique à l’Université de Memphis, a apporté son expertise en informatique géospatiale.

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