Les chercheurs de l’Université Chung-Ang ont évalué ma

Sensibilité d'identification de trois systèmes de spectrométrie de masse (MS) MALDI-TOF pour l'identification de champignons filamenteux

image : La sensibilité et la précision de trois approches MALDI-TOF MS pour l’identification des champignons filamenteux ont été déterminées par des chercheurs de l’Université Chung-Ang.
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Crédit : Prof. Mi-Kyung Lee de l’Université Chung-Ang

Ces dernières années, des champignons filamenteux ou des moisissures sont apparus comme agents responsables d’infections potentiellement mortelles chez les personnes immunodéprimées. La prise en charge rapide de ces infections nécessite un diagnostic rapide et précis des moisissures en milieu clinique.

Malheureusement, les méthodes traditionnelles prennent du temps, étant donné les longues périodes d’incubation nécessaires pour cultiver et examiner les moisissures. D’autre part, les techniques moléculaires avancées sont plus sensibles et efficaces. L’une de ces techniques permettant de détecter des isolats fongiques filamenteux avec une sensibilité et une reproductibilité élevées est la “spectrométrie de masse par ionisation par désorption laser assistée par matrice (MALDI-TOF MS)”. Il peut différencier les échantillons en fonction des variations de masse et de charge. Cependant, il n’est pas largement utilisé en raison des limites de disponibilité de la base de données et du manque de procédures standardisées.

Récemment, une équipe de chercheurs de l’Université de Chung-Ang, en République de Corée, dirigée par le professeur Mi-Kyung Lee, a évalué trois approches MALDI-TOF MS différentes utilisées dans les contextes cliniques nationaux, pour l’identification des moisissures.

Dans leurs étude publiée dans Le Journal de microbiologie clinique le 26 octobre 2022, ils ont comparé les performances et la précision diagnostique du Bruker Biotyper, ASTA MicroIDSys et Vitek MS. Ils ont également évalué la sensibilité de trois méthodes de prétraitement – “direct”, “sur plaque” et “en tube” – en utilisant 84 isolats de champignons filamenteux.

Expliquant la justification de leur étude, le professeur Lee remarque, « La sélection d’une méthode de préparation d’échantillon appropriée peut améliorer l’efficacité et la précision de l’identification des moisissures. De plus, le développement de processus systématisés au niveau du diagnostic peut finalement contribuer à des traitements efficaces pour les patients »

L’étude a révélé que le Bruker Biotyper a identifié correctement 71,43 % des isolats jusqu’au niveau de l’espèce ou du genre, tandis que ASTA MicroIDSys et Vitek MS ont démontré des taux de précision de 70,24 % et 55,95 %, respectivement. De plus, la méthode directe de préparation des échantillons était favorable aux deux autres méthodes, en raison de sa simplicité et de sa facilité d’application. Notamment, la sensibilité d’identification ne différait pas significativement entre les différentes méthodes de préparation des échantillons.

Le taux d’erreur d’identification est une considération importante dans les laboratoires cliniques car il peut conduire à des interventions thérapeutiques inappropriées pour les patients. Dans cette étude, un seul isolat a été mal identifié en utilisant Vitek-MS avec la méthode sur plaque. De plus, l’identification au niveau de l’espèce de Aspergillus (un micro-organisme très répandu et cliniquement significatif) était le plus élevé grâce à Vitek-MS, indiquant l’applicabilité de cette technique en milieu clinique.

Le nombre d’espèces incorrectement identifiées était de 17, 15 et 23 via le Bruker Biotyper, ASTA MicroIDSys et Vitek MS, respectivement. L’équipe a suggéré la nécessité d’évaluations supplémentaires en cas d’erreur d’identification due à l’absence de certaines espèces dans la bibliothèque plutôt qu’à une erreur. De plus, l’équipe a déterminé que toute différence de sensibilité pouvait être attribuée à des différences dans les bases de données du système.

En résumé, MALDI-TOF MS est une technique précieuse qui peut identifier avec précision les micro-organismes cliniquement significatifs en temps opportun. La normalisation des processus et les lignes directrices qui peuvent être appliquées à un large éventail d’espèces peuvent aider à réduire le biais de processus qui se produit grâce à ces techniques. De plus, les limitations liées aux paramètres d’acquisition, à la qualité de la matrice et au matériel nécessitent des évaluations supplémentaires.

Interrogé sur les applications de l’étude, le professeur Lee déclare : « Notre étude est la première à comparer la sensibilité et la précision de trois instruments MALDI-TOF MS ainsi que l’efficacité de trois méthodes de prétraitement pour l’identification des champignons filamenteux. Des résultats précis obtenus grâce à un processus simple et rationalisé d’identification des moisissures à l’aide de MALDI-TOF MS pourraient améliorer l’efficacité du travail de laboratoire pour les utilisateurs et l’efficacité du traitement pour les patients.

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Référence

EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1128/jcm.00812-22

Auteurs : Yoojeong Choiun, Daewon KimbKye a gagné ChoeunHyukmin LeecJae Seok KimJeong Yeal Ahnbet Mi-Kyung Leeun

Affiliations :

unDépartement de médecine de laboratoire, Collège de médecine de l’Université Chung-AngSéoul, République de Corée

bDépartement de médecine de laboratoire, Gachon University Gil Medical Center, Incheon, République de Corée

cDépartement de médecine de laboratoire et Institut de recherche sur la résistance bactérienne, Yonsei University College of Medicine, Séoul, République de Corée

Département de médecine de laboratoire, Kangdong Sacred Heart Hospital, Hallym University College of Medicine, Séoul, République de Corée

À propos de l’Université Chung-Ang

L’Université Chung-Ang est une université privée de recherche complète située à Séoul, en Corée du Sud. Il a été lancé en tant que jardin d’enfants en 1916 et a obtenu le statut d’université en 1953. Il est entièrement accrédité par le ministère de l’Éducation de Corée. L’Université Chung-Ang mène des activités de recherche sous le slogan « Justice et vérité ». Sa nouvelle vision pour terminer ses 100 ans est « Le leader mondial de la création ». L’Université Chung-Ang propose des programmes de premier cycle, de troisième cycle et de doctorat, qui englobent une faculté de droit, un programme de gestion et une école de médecine; il compte 16 écoles de premier cycle et des cycles supérieurs chacune. Les programmes culturels et artistiques de l’Université Chung-Ang sont considérés comme les meilleurs de Corée.

Site Internet: https://neweng.cau.ac.kr/index.do

À propos du professeur Mi-Kyung Lee de l’Université Chung-Ang

Dr Mi-Kyung Lee est professeur au Département de médecine de laboratoire du Collège de médecine de l’Université Chung-Ang. Elle détient un doctorat en médecine de laboratoire et a plus de 230 publications à son actif. Avec une expérience de recherche de plus de deux décennies dans les domaines de la microbiologie clinique et de la génétique moléculaire, ses recherches se concentrent actuellement sur les infections fongiques et la sensibilité aux médicaments antifongiques. Avec le soutien de la Fondation coréenne pour la science et l’ingénierie, elle a terminé avec succès une bourse de formation d’un an dans la branche des maladies mycotiques, Centers for Disease Control and Prevention à Atlanta, Géorgie, États-Unis en 2002, après quoi elle mène régulièrement des études épidémiologiques et moléculaires. études de micro-organismes cliniques (en particulier les Candidose espèces) en Corée du Sud.


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